基本仕様のシンプルさ、テンプレートシステムの柔軟性・拡張性の高さ、URL設定の自由度の高さ、高度なキャッシュ制御による軽快な動作、充実のユーザ権限管理（※ただし承認フローは未実装）、Ajaxを活用したスタイリッシュかつ操作性の高い管理画面が特長。
多くの有名CMSのコンテンツ構造が制限なくコンテンツを追加していけるスタック型であるのに対し、MODxはサイトの全貌を直感的に把握しやすいツリー型を採用している。WindowsやMacなどPCのファイルシステムがツリー構造（またはディレクトリ構造）であるのとイメージが近く、CMS初心者には理解しやすい構造である。必ずしもドキュメントの頂上がサイトのトップページになるわけではなく、ツリー内のどのページでも、自由にトップページに指定できる。これは、Windowsの「デスクトップ」の実体がルートに存在しないのと似ている。
